Trước đây, Linh Trung là một xã thuộc huyện Thủ Đức cũ, được thành lập vào ngày 14 tháng 2 năm 1987 trên cơ sở một phần diện tích và dân số của xã Linh Xuân.[4]

Sau khi thành lập, xã Linh Trung có 472 ha diện tích tự nhiên và 9.114 người.

Ngày 6 tháng 1 năm 1997, Chính phủ ban hành Nghị định số 03-CP[1]. Theo đó:

• Thành lập quận Thủ Đức trên cơ sở toàn bộ diện tích và dân số của thị trấn Thủ Đức và 7 xã: Hiệp Bình Chánh, Hiệp Bình Phước, Linh Đông, Linh Trung, Linh Xuân, Tam Bình, Tam Phú; một phần diện tích và dân số của các xã Hiệp Phú, Tân Phú và Phước Long thuộc huyện Thủ Đức cũ
• Thành lập phường Linh Tây thuộc quận Thủ Đức trên cơ sở 61 ha diện tích tự nhiên và 10.158 người của thị trấn Thủ Đức; 80 ha diện tích tự nhiên và 1.680 người của xã Linh Trung
• Thành lập phường Linh Trung thuộc quận Thủ Đức 328 ha diện tích tự nhiên và 10.630 người còn lại của xã Linh Trung; 298 ha diện tích tự nhiên và 3.138 người của xã Tân Phú; 55 ha diện tích tự nhiên và 366 người của xã Hiệp Phú.

Sau khi thành lập, phường Linh Trung có 681 ha diện tích tự nhiên và 14.134 người.

Ngày 9 tháng 12 năm 2020, Ủy ban thường vụ Quốc hội ban hành Nghị quyết 1111/NQ-UBTVQH14 về việc thành lập thành phố Thủ Đức trên cơ sở sáp nhập toàn bộ diện tích và dân số của Quận 2, Quận 9 và quận Thủ Đức[5], phường Linh Trung thuộc thành phố Thủ Đức như hiện nay.